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Vol. 1 No. 1 (2009)

Evaluation of the genetic variability of tamarillo

DOI
https://doi.org/10.18272/aci.v1i1.13
Submitted
June 23, 2015
Published
2009-04-01

Abstract

El presente trabajo determinó el nivel de diversidad genética existente en varios cultivos de tomate de árbol (Solanum betaceum) de las provincias de Imbabura, Tungurahua y Pichincha, mediante el uso de marcadores microsatélites. Además, se evaluó el nivel de transferibilidad al tomate de árbol, de 53 pares de primers microsatélites desarrollados originalmente para papa (Solanum tuberosum). Se usó 50 accesiones, que abarcaron las seis variedades de tomate de árbol posibles, de acuerdo al tamaño/forma y color del mucílago del fruto. El porcentaje de pares de primers que amplificaron con éxito fue de 28.3 %.

Los loci amplificados mostraron mayoritariamente un patrón monomórfico. El porcentaje de primers polimórficos fue de 7.5%. El valor PIC para cada par de primers varió entre 0.077 y 0.514. En solo 5 de los 11 loci utilizados para el análisis, se observaron individuos heterocigotos. El porcentaje de individuos heterocigotos para estos loci varió entre 4 y 98 %. El acervo genético de las accesiones analizadas parece ser estrecho y homogéneo. Se detectaron valores altos de similitud genética entre las accesiones (80 - 100%), usando el coeficiente de Jaccard. El método de agrupamiento UPGMA demostró que las accesiones no se asociaban ni por lugar de origen, ni por variedad. Estos resultados son congruentes con los obtenidos en estudios anteriores. El bajo porcentaje de transferencia de primers (28.3%) indica que las secuencias que flanquean a los microsatélites no se han conservado en el proceso de especiación de la papa y el tomate de árbol. La reducida diversidad genética en los cultivos de tomate de árbol podría explicarse por un proceso relativamente reciente de domesticación de la especie, y por una conjunción de factores geográficos/ecológicos, y fenológicos, que fomentan la homogenización genética entre y dentro de los cultivos.

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References

  1. Bohs, L. 1989. "Ethnobotany of the Genus Cyphomandra (Solanaceae)". Economic Botany, 43(2): 143-163.
  2. Albornoz, G. 1992. El tomate de árbol (Cyphomandra betacea Sendt.) en el Ecuador. Universidad Central del Ecuador-Fundagro, Quito.
  3. Morales, J.O. 2001. "Diagnóstico agro-socio­económico del cultivo de tomate de árbol (Cyphomandra betacea Sendt.) en cuatro provincias de la sierra ecuatoriana (Imbabura, Pichincha, Tungurahua y Azuay)". Tesis de grado previa a la obtención de título de Ingeniero Agrónomo de la Universidad Central del Ecuador, Quito.
  4. Mohammadi, S.A. & Prasanna, B.M. 2003. "Analysis of Genetic Diversity in Crop Plants - Salient Statistical Tools and Considerations". Crop Science: 43, 1235 -1248.
  5. Tanksley, S.D.; Mccouch, S.R. 1997. "Seed Banks and Molecular Maps: Unlocking Genetic Potential from the Wild". Science 277: 1063-1066.
  6. Nuez, F.; Carrillo, J.M. (Eds.). 2000. Los marcadores genéticos en la mejora vegetal. Editorial Universidad Politécnica de Valencia. Valencia, España.
  7. Azofeifa-Delgado, A. 2006. "Revisión Bibliográfica: Uso de marcadores moleculares en plantas; aplicaciones en frutales del trópico". Agronomía Mesoamericana 17(2): 221-242.
  8. Powell, W.; Machray, G.C.; Provan, J. 1996. "Polymorphism revealed by simple sequence repeats." Trends in Plant Science 1(7): 215-222.
  9. Kyndt, T., Van Droogenbroeck, B., Haegeman, A., Roldán-Ruiz, I. & Gheysen, G. 2006. "Cross-species microsatellite amplification in Vasconcellea and related genera and their use in germplasm classification." Genome 49: 786-798.
  10. Shepherd, M.; Cross, M.; Maguire, T.L.; Dieters, M.J.; Williams, C.G.; Henry, R.J. 2002. "Transpecific microsatellites for hard pines". Theor Appl Genet 104: 819-827.
  11. Peakall, R.; Gilmore, S.; Keys, W.; Morgante, M.; Rafalski, A. 1998. "Cross-species amplification of soybean (Glycine max) Simple Sequence Repeats (SSRs) within the genus and other legume genera: implications for the transferability of SSRs in plants." Mol. Biol Evol 15(10): 1275-1287.
  12. Saghai Maroof, M.A.; Solima, K.M.; Jorgenson, R.A.; Allard, R.W. 1984. "Ribosomal DNA spacer- length polymorphisms in barley: Mendelian
  13. inheritance, chromosomal location, and population dynamics." Proc. Nac. Acad. Sci. USA 81: 8014­8018.
  14. CIP - Centro Internacional De La Papa. 2000. Molecular Biology Laboratory Protocols: Plant Genotyping. Ma. del R. Herrera; M. Ghislain; D. Zhang (Eds.), Crop Improvement and Genetic Resources Department Training Manual. Tercera edición, Lima, Perú.
  15. Benbouza, H.; Jacquemin, J.M.; Baudoin, J.P.; Mergeai, G. 2006. "Optimization of a reliable, fast, cheap and sensitive silver staining method to detect SSR markers in polyacrylamide gels." Biotechnol. Agron. Soc. Environ. 10 (2): 77-81.
  16. Escribano, P.; Viruel, M.A.; Hormaza, J.I. 2004. "Characterization and cross-species amplification of microsatellite markers in cherimoya (Annona cherimola Mill., Annonaceae)", Primer Note. Molecular Ecology Notes 4: 746-748.
  17. Garner, T.W.J. 2002. "Genome size and microsatellites: the effect of nuclear size on amplification potential." Genome 45: 212-215.
  18. Pringle, G.J.; Murray, B.G. 1991. "Karyotype Diversity and Nuclear DNA Variation in Cyphomandra" en Solanaceae III: Taxonomy,
  19. Chemistry, Evolution; ed. Hawkes, Lester, Nee & Estrada; Royal Botanic Gardens Kew and Linnean Society of London.
  20. Nybom, H. 2004. "Comparison of different nuclear DNA markers for estimating intraspecific genetic diversity in plants." Molecular Ecology 13: 1143­1155.
  21. Ghislain, M.; Spooner, D.M.; Rodríguez, F.; Villamón, F.; Núñez, J.; Vásquez, C.; Waugh, R.; Bonierbale, M. 2004. "Selection of highly informative and user-friendly microsatellites (SSRs) for genotyping of cultivated potato." Theor Appl Genet 108: 881-890.
  22. Tapia, C.; Zambrano, E.; Morillo, E. 2006. "Tomate de árbol (Cyphomandra betacea Sendt.), frutal promisorio para la diversificación del agro andino." Informe de Proyecto ejecutado por INIAP/DENAREF.
  23. Ordóñez, S. 2007. "Diferenciación de variedades en cultivos de tomate de árbol, Solanum betaceum, mediante la técnica molecular de AFLP." Tesis de grado presentada como requisito para la obtención de título de B.S. en Biotecnología de la Universidad San Francisco de Quito. Quito, Ecuador.
  24. Reif, J.C.; Zhang, P.; Dreisigacker, S.; Warburton, M.L.; Van Ginkel, M.; Hoisington, D.; Bohn, M.; Melchinger, A.E. 2005. "Wheat Genetic Diversity Trends During Domestication and Breeding." Theor Appl Genet 110: 859-864.
  25. Levi, A.; Thomas, C.E.; Whener, T.C.; Zhang, X. 2001. "Low genetic diversity indicates the need to broaden the genetic base of cultivated watermelon." HortSience 36 (6): 1096-1101.
  26. Navot, N.; Zamir, D. 1987. "Isozyme and seed protein phylogeny of the genus Citrullus (Cucurbitaceae)." Plant Syst. Evol. 156: 61-67.
  27. González-Astorga, J.; Castillo-Campos, G. 2004. "Genetic Variability of the Narrow Endemic Tree Antirhea aromatica Castillo-Campos & Lorence, (Rubiaceae, Guettardeae) in a Tropical Forest of Mexico." Annals of Botany 93: 521-528.
  28. Lewis, D.H.; Considine, J.A. 1999. "Pollination and fruit set in the tamarillo (Cyphomandra betacea (Cav.) Sendt.) 1. Floral biology." New Zealand Journal of Crop and Horticultural Science 27: 101­112.
  29. Zhou, S.L.; Xiong, G.M.; Li, Z.Y.; Wen, J. 2005. "Loss of genetic diversity of domesticated Panax notoginseng F H Chen as evidenced by ITS sequence and AFLP polymorphism: a comparative study with P. stipuleanatus. H T Tsai et K M Feng." Journal of Integrative Plant Biology 47(1): 107-115.

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