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SECCIÓN B: CIENCIAS BIOLÓGICAS Y AMBIENTALES

Vol. 7 Núm. 1 (2015)

Identificación de alelos S asociados con autoincompatibilidad en individuos de capulí (<em>Prunus serótina</em> subsp. <em>capulí</em>) mediante la amplificación del Intrón I del gen de la S-RNasa

DOI
https://doi.org/10.18272/aci.v7i1.224
Enviado
noviembre 24, 2015
Publicado
2015-05-22

Resumen

La autoincompatibilidad gametofítica es un mecanismo genético que ha evolucionado para prevenir la autofecundación en varias familias de plantas; su funcionamiento está regulado por el locus S y ha sido identificado en varias especies del género Prunus. El conocimiento de la composición alélica S de individuos y cultivares de especies frutales es esencial para el establecimiento de huertos productivos, mediante la definición de combinaciones entre cultivares compatibles. La identificación y clonación de genes de S-RNasas en especies del género Prunus ha permitido el desarrollo de técnicas moleculares para la caracterización de genotipos S en varias especies silvestres y especies poco estudiadas del género. El presente estudio evaluó 80 individuos de capulí (Prunus serotina subsp. capuli) colectados en 8 provincias de la Sierra ecuatoriana para determinar la diversidad alélica del locus S, utilizando primers degenerados diseñados a partir de regiones conservadas del gen de la S-RNasa de varias especies del género Prunus. Los productos de PCR fueron separados en geles de agarosa de acuerdo a su tamaño y los amplicones polimórficos fueron secuenciados. El análisis de las secuencias reportó un total de 11 alelos presentes en la muestra estudiada y además mostró la existencia de similitud con secuencias de distintas especies del género Prunus. Se podría especular que las secuencias encontradas en P serotina que presentan un alto porcentaje de identidad con las secuencias reportadas en otras especies del género fueron heredadas a partir de un ancestro común que ya las poseía. Por otro lado, las secuencias con un menor porcentaje de identidad habrían tenido orígenes independientes en las distintas especies. El uso de primers consenso degenerados permitió realizar un screening rápido y eficiente de los individuos de capulí analizados, mediante la asignación de genotipos putativos. Los resultados obtenidos en este estudio deben ser complementados con pruebas en el campo para confirmar el comportamiento fenotípico de los individuos de capulí estudiados.

Citas

  1. De Nettancourt, D. 2001. "Incompatibility and and Incongruity in Wild and Cultivated Plants." Springer-Verlar, Berlin,: 322.
  2. Newbigin, E.; Anderson, A.; Clarke, A. 1993. "Gametophytic self-incompatibility systems." The Plant Cell, 5: 1315-1324.
  3. Haring, V; Gray, J.; McClure, B.; Anderson, M.; Clarke, A. 1990. "Self-incompatibility: a self-recognition system in plants." Science, 250: 937-941.
  4. Kao, T.; McCubbin, A. 1996. "How flowering plants discriminate between self and non-self pollen to prevent inbreeding." Proceedings of the National Academy of Sciences USA, 93: 12059-12065.
  5. Intriago, D. 2013. "Análisis de la diversidad genética del capulí (Prunus serotina subsp. capulí) en la región interandina del Ecuador mediante marcadores microsatélites." Universidad San Francisco de Quito, Tesis de Pregrado: Quito - Ecuador.
  6. Guadalupe, J. 2013. "Estudio preliminar de la diversidad genética del capulí en cinco provincias de la región andina del Ecuador." Universidad San Francisco de Quito, Tesis de Pregrado: Quito - Ecuador.
  7. Crane, M.; Brown, A. 1937. "Incompatibility and sterility in the sweet cherry, Prunus avium." J Pomol Hort Sci, 15: 86-116.
  8. Crossa-Raynaud, P.; Grasselly, C. 1985. "Éxistence de groupes d"™interstérilité chez l"™amandier." Options Méditerr. Serie Études, 1: 43-45.
  9. Kester, D.; Gradziel, T.; Micke, W. 1994. "Identifying pollen incompatibility groups in California almond cultivars." Journals of the American Society for Horticultural Science, 119: 106-109.
  10. Boskovic, R.; Tobutt, K.; Batlle, I.; Duval, H. 1997. "Correlation of ribonuclease zymograms and incompatibility genotypes in almond." Euphytica, 97: 167-176.
  11. Boskovic, R.; Tobutt, K. 2001. "Genotyping cherry cultivare assigned to incompatibility groups, by analysing stylar ribonucleases." Theor Appl Genet, 103: 475-485.
  12. Ushijima, K.; Sassa, H.; Tao, R.; Yamane, H.; Dandekar, A.; Gradziel, T.; Hirano, H. 1998. "Cloning and characterization of cDNAs encoding S-RNases from almond (Prunus dulcis): primary structural features and sequence diversity of the S-RNases in Rosaceae." Molecular Genetics, 260: 261-268.
  13. Sonneveld, T.; Tobutt, K. 2003. "Allele-specific PCR detection of sweet cherry self-incompatibility (S) alleles S1 to S16 using consensus and allele-specific primers." Theoretical and Applied Genetics, 107 (6): 1059-1070.
  14. Tamura, M.; Ushijima, K.; Sassa, H.; Hirano, H.; Tao, R.; Gradziel, T.; Dandekar, A. 2000. "Identification of self-incompatibility genotypes of almond by allele specific PCR analysis." Theoretical and Applied Genetics, 101 (3): 344-349.
  15. Ortega, E.; Sutherland, B.; Dicenta, F.; Boskovic, R.; Tobutt, K. 2005. "Determination of incompatibility genotypes in almond using first and second intron consensus primers: detection of new S alleles and correction of reported S genotypes." Plant Breeding, 124 (2): 188-196.
  16. Popenoe, W.; Pachano, A. 1922. "The Capulín Cherry." Journal of Heredity, 13: 50-62.
  17. Mille, L. 1942. "El Capulí." FLORA-Instituto de Ciencias Naturales del Ecuador, 2: 50-51.
  18. Wu, J.; Gu, C.; Khan, M.; Gao, Y; Wang, C.; Zhang, S. 2013. "Molecular Determinants and Mechanisms of Gametophytic Self-Incompatibility in Fruit Trees of Rosaceae." Critical Reviews in Plant Sciences, 32 (1): 53-68.
  19. Ortega, E.; Boskovic, R.; Sargent, D.; Tobutt, K. 2006. "Analysis of S-RNase alleles of almond (Prunus dulcis): characterization of new sequences, resolution of synonyms and evidence of intragenic. Molecular Genetics and Genomics: MGG, 276 (5): 413-426.
  20. Rahemi, A.; Fatahi, R.; Ebadi, A.; Taghavi, T.; Hassani, D.; Gradziel, T.; Chaparro, J. 2010. "Genetic variation of S-alleles in wild almonds and their related Prunus species." Australian Journal of Crop Science. Retrieved from http://www.highbeam.com/doc/1P3-2243615241.html.
  21. De Cuyper, B.; Sonneveld, T.; Tobutt, K. 2005. "Determining self-incompatibility genotypes in Belgian wild cherries." Molecular Ecology, 14 (4): 945-955.
  22. Downey, S.; Iezzoni, A. 2000. "Polymorphic DNA Markers in Black Cherry (Prunus serotina) Are Identified Using Sequences from Sweet Cherry, Peach, and Sour Cherry." Journal of the American Society for Horticultural Science, 125 (1): 76-80.
  23. Halász, J.; Fodor, A.; Hegedüs, A.; Pedryc, A. 2008. "Identification of a new self-incompatibility allele (S31) in a Hungarian almond cultivar and its reliable detection." Scientia Horticulturae, 116 (4): 448-451.
  24. Banovic, B.; Survanovsky, N.; Konstantinovic, M.; Maksimovic, V 2007. "Basic RNases of wild almond (Prunus webbii): cloning and characterization of six new S-RNase and one non-S RNase genes." Journal of Plant Physiology, 166 (4): 395-402.
  25. Sonneveld, T.; Robbins, T.; Boskovic, R.; Tobutt, K. 2001. "Cloning of six cherry self-incompatibility alleles and development of allele-specific PCR detection." Theoretical and Applied Genetics, 102: 1046-1055.
  26. Yaegaki, H.; Shimada, T.; Moriguchi, T.; Hayama, H.; Haji, T.; Yamaguchi, M. 2001. "Molecular characterization of S-RNase genes and S-genotypes in the Japanese apricot (Prunus mume)." Sexual Plant Reproduction, 13 (5): 251-257.
  27. Beppu, K.; Yamane, H.; Yaegaki, H.; Yamaguchi, M.; Kataoka, I. 2002. "Diversity of S-RNase genes and Shaplotypes in Japanese plum (Prunus salicina Lindl.). " The Journal of Horticultural Science and Biotechnology, 77: 658-665.
  28. Ioerger, T.; Clark, A.; Kao, T. 1990. "Polymorphism at the self-incompatibility locus in Solanaceae predates speciation." Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 87 (24): 9732-9735.

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