Los manatíes amazónicos viven en ríos de aguas negras y lagunas de la Cuenca Amazónica. La primera información sobre la distribución y el estado de conservación de manatíes en la Reserva Cuyabeno proviene de un estudio realizado en 1983 por Timm y otros [1]. Ellos concluyeron que el manatí se puede extinguir en la próxima década. En este artículo se presenta los resultados de observaciones y entrevistas realizados desde 1996 a 1999, trece años después. Durante 127 días de monitoreo del Delfín Amazónico (Inia geoffrensis) en el habitat del manatí a lo largo de ríos y lagunas de agua negra, se observó durante 456 horas. Adicionalmente se realizaron monitoreos dirigidos a manatíes en las Lagunas Grandes de Cuyabeno. Entrevistas con guías de turismo, guardaparques e indígenas dan una lista completa de avistamientos de manatíes, su distribución y la situación de conservación. La abundancia relativa estimada en el Río Cuyabeno es de 0,01 animales/hora de esfuerzo y aün menor en el río Lagartococha con 0,007 animales/ hora de esfuerzo. Las poblaciones en el rio Lagartococha parecen severamente reducidas. En ambos ríos la caza entre 1995 y 1998 continuó. A pesar de la protección legal se mataron al menos 16 animales dentro de la Reserva Cuyabeno, por ende el hecho de vivir en una area protegida no necesariamente significa la sobrevivencia de la especie.
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