Se determinó la diversidad genética de 41 cepas ecuatorianas de hongos entomopatógenos y un aislamiento de los EEUU, de una colección mantenida por el INIAP (Instituto Nacional Autónomo de Investigaciones Agropecuarias) utilizando un protocolo modificado de AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism). Se encontraron índices de similitud genéticos inferiores a 0.50 y 121 bandas polimórficas. El análisis AMOVA reveló que la variación entre grupos y dentro de grupos contribuían en cantidades similares (59% y 41% respectivamente) a la variación genética total detectada. El dendograma construido a partir del coeficiente genético de Jaccard muestra doce grupos, de los cuales siete contienen aislamientos agrupados por género. De estos siete grupos, cinco contienen aislamientos agrupados en base al huésped de donde se recolectaron. Los valores de Bootstrap muestran doce relaciones filogenéticas confiables con valores de confianza mayores al 70%. El análisis de componentes principales (PCA) produjo seis grupos; cuatro de ellos contienen aislamientos asociados por género. Estos resultados sugieren la existencia de una diversidad genética considerable dentro de la colección de hongos entomopatógenos del INIAP, y una tendencia de agrupamiento relacionada con el huésped de donde fueron aislados. No se encontraron regiones genómicas comunes dentro de las cepas más virulentas de hongos entomopatógenos. La elevada diversidad genética dentro de esta colección representa una fuente potencial de genotipos con actividad bioinsecticida potente.
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